Zaklada Carlsberg osnovana je 1876. godine, kada je J. C. Jacobsen osigurao budućnost svoje pivovare, prenijevši je na upravljanje Danskoj kraljevskoj akademiji znanosti i književnosti. Od tada Zaklada Carlsberg upravlja Carlsberg grupacijom, vodeći računa da pivovara radi s fokusom na inovacije i proizvodnju kvalitetnih proizvoda, istovremeno podržavajući istraživanja u okviru prirodnih, društvenih i humanističkih znanosti. Sve u skladu sa željama i vizijom osnivača. Brigu za budućnost i opstanak Carlsberga Jacobsen je pokazao kada je napravio ugovor o njegovu prijenosu Danskoj kraljevskoj akademiji znanosti i književnosti.

U to vrijeme, kao i danas, Akademija je bila mjesto susreta danskih elitnih istraživača. Odluka koju je tada donio Jacobsen bila je izuzetno revolucionarna, vizionarska i trajna. Njegova želja bila je da zaklada Carlsberg, sa svojim dubokim korijenima koje ima u znanosti, osigura da, čak i nakon njegove smrti, Carlsberg stalno unaprjeđuje proces proizvodnje piva i nastavi proizvoditi pivo vrhunske kvalitete. Zaklada Carlsberg preuzela je vlasništvo i upravljanje Starim Carlsbergom, nakon što je Jacobsen preminuo tijekom posjeta Rimu 1887. godine. Carlsberg grupacija trenutno je jedina globalna pivovara koja se nalazi u vlasništvu fondacije.